『명탐정 코난』제84권. 쿠도 신이치는 세계적인 추리소설가 아버지를 둔 고교생 탐정. 발군의 추리력으로 숱한 난제 사건들을 해결해 왔다. 그러던 어느 날 소꿉친구 모리 란과의 데이트 도중, 검은 조직 사내들의 거래를 목격하는 바람에 입막음을 위해 독약으로 제거당할 뻔한다. 가까스로 목숨은 건졌지만, 초등학교 1학년생의 모습으로 변해버린 신이치. 이리하여 그는 에도가와 코난이란 이름으로 검은 조직 사내들과 연결된 단서를 잡을 수 있을 거라 믿고, 자신의 주변에서 일어나는 사건들을 계속 풀어나가기로 한다. 쿠도 신이치로서 자신을 되찾기 위해, 란에게 정체를 숨긴 채….